我國自從實施健保以來，有三項破世界紀錄的成績，就是：高達九成六的加保率、最低的行政成本和最低的保險費率。由於健保屬於強制保險，參加率高是必然，但也因為國人的合作才有這麼高的參加率，這是值得肯定的。而超低的行政費用固然很好，卻也是造成日後困擾的主因。因為捨不得花行政費用，所以無法將健保制度做得周延，以至於漏洞及不合理的項目相當多。最糟糕的是，一開始訂了太低的保險費率，造成崩盤的危機。美國的健保只做老人跟貧戶而已，但美國用了美國GDP（國民生產毛額）3萬多美金的16.5%，我們卻只用我國GDP（國民生產毛額）1萬2千美金的4.5%，金額相差十幾倍；加上健保局將健保法規定不能由健保給付的指示用藥（如胃藥）、傳染病（如愛滋病）、預防性醫療（如肝炎防治）、老人健檢等應該由其它預算支付的，健保通通給付了，財務上的缺口卻要由醫療院所來承擔。因為健保實施總額給付，且人口老化，醫療需求不斷升高，以致於亞東醫院今年第一季的門診和急診，除藥費一點給一元之外，浮動點值原本一點給一元，改為只給付四毛六。而且這只是第一季而已，往後點值還會持續下降。
亞東醫院在朱院長帶領下，致力於改善醫療及服務品質，朝醫學中心邁進，業務量也因而大幅成長，不但在區域醫院裡居冠，甚至高出許多醫學中心。但也由於其正規經營的高成長，在健保財務缺口困境下，被砍掉的錢反而最多，變成最大的受害者。在帳目上，一年累積的點值損失高達5億5千萬元。
自今年第三季，健保局推出「卓越計劃」，意即將醫院前一年的給付總額，加上規定的年成長率作為上限，以協商取得第二年的總額。表面上看來很合理，但只要醫院的成長率高過規定成長率的好幾倍，醫院一毛錢也拿不到。這對成長型的醫院而言，不啻是莫大的損傷，不但醫院的發展從此只侷限於規定的範圍，再者，健保支付額的起始值亦是不敷醫院成本。
舉例而言，一家販賣家電的商店，去年賣出130台電視機及140台冰箱，由於員工的專業努力及服務改善，今年營業額勢必更蒸蒸日上。但政府卻說：今年經濟不景氣，如果你參加政府聯營，不論明年賣到多少台，總共最多只能收到100台電視機及80台冰箱的給付，至於單價則由政府訂定，而且價格在半年以後才會告訴你，政府並保有隨時調整單價的權力。雖然你最多只能收到100台電視機及80台冰箱的給付，但不准有缺貨的情況，只要有人叫貨，就一定要出貨。如果賣出140台電視機及180台冰箱，你就認了，多出的40台電視機及100台冰箱就算是捐贈的。如果賣不到100台電視機及80台冰箱，則依實際台數給付，且兩者數量不可以相互流用。政府還要看你的服務品質及態度，一旦有人抱怨，政府隨時要再扣錢。相反的，要是你不參加聯營，這些產品的單價則需以全國未參加聯營的銷售總量來分政府給的總額預算，可能冰箱第一季的單價會是去年的46.3％，往後再逐季調低，沒有底限。
許多醫院在這種嚴峻的衝擊下，紛紛加入卓越計劃，然後再行萎縮業務量，以求平衡收支，更因為緊縮業務量，服務量減少，病人被各醫院推諉無人收容，導致所謂「人球」的詬病。事實上，我們非常不贊同這種退縮而自我侷限的政策。
亞東醫院秉持創辦人設置徐元智醫藥基金會時的四大目的：自建醫院、急病救助、貧困救助及支持醫學研究等為基本原則來進行策劃應變，以求醫院的永續經營及蓬勃發展。首先確立不能拒絕病患的基本天職，但又必須維護醫院永續經營及發展的需要，因此開始積極進行體質改造，視危機為轉機，讓醫院的體質更加健全，才能達成任務。
本院的經營目標是將健保範圍的服務效率更加提升，以便騰出相對部分的能力空間，進行非健保的健康產業。醫院不但不可以萎縮業務，反而應該更提升，以高而有效率的活力，讓業務持續成長。
持續改善醫療及服務品質，朝醫學中心邁進，以求有更高的競爭力。鼓勵團隊綜效，期以團隊服務的力量超越過去醫師個人的能力極限。醫療能力提升就能縮短住院時間及節省醫療費用，別人9天才能治好，如果我們6天治好，就有30％的空間可以騰出來，以服務更多的病患及發展健康產業。
精簡及去除不具確定性或必要性的檢查及藥物，並與策略聯盟的基層醫療院所合作，真正做到「醫院看重病，聯合門診及診所看小病」的分層功能，回歸正常的醫療體系及功能。
台北縣是全國醫療資源最貧乏的地方，不論是每萬人人口的西醫醫師數或病床數，都是全國最低，過去台北縣民都必須越過淡水河，到資源過剩的台北市就醫。本院的目標社區則是板橋、土城、樹林及中、永和等地，因其不斷有外來人口移入，在全國人口銳減的趨勢當中，還不斷逆勢成長，所以醫療資源更形匱乏。如果政府要平衡城鄉差距，亞東醫院需要有三倍以上的服務量成長才夠。但本院原有床位已經相當擁擠，三人一間的健保床高達總床位之75%，相對於衛生署規定的55%，高出20%。光是要改善這20%就需要相當大的空間，加上要增加健康產業的空間需求，即使不擴床，勢必還是要擴建。這20%病床的差額收入也相當可觀，在經營困難的時候，對醫院來講是相當重要的。可是現在健保財源拮据，生怕醫院擴床會增加健保支出，衛生署是否核准尚屬未知。
朝健康管理的新方向前進，維護社區居民的健康，才是根本之道。亞東醫院在一樓大廳推出每天衛教講座，真正教導社區居民健康知識。將健檢中心改制為健康管理中心，以積極管理代替消極篩檢，以期有效提升健康；並將家庭醫學科從過去開業醫的性質，改為社區醫學的規劃，真正落實家庭醫師的特性。
醫院需要永續經營，應不只力求收支平衡，還需有盈餘來擴充發展，更不可長期仰賴基金會資助，所以節制成本勢在必行，而且要加快腳步。
1.醫材、耗材進行群組競標：成立群組競標小組，積極進行數
以萬計醫材的群組競標。因為過去幾年來，我們藥品的群組
競標相當成功，延此經驗，相信可以省下相當多的成本。
2.進行全院垃圾減量：因為醫療廢棄物需要高價請人焚化，減
量會有相當的經濟效益。
3.全院省電計劃：空調是電力消耗最大的成因，對夜間未使用
的空間進行節約計劃。
4.節約用水、紙張、衛生紙、消耗品等林林總總的支出。
5.加快全面進行資訊電腦化，達到病歷無紙化、X光無片化。
6.擴建及發展健康產業，對經營困境不無小補，投資還本期間
約為一年。
寧可今年虧損，也不能讓日後醫院的總額縮水，以致於減少醫院對縣民的服務量。因為浮動點值（健保給付每一申報點所實際給的錢）93年第一季門診是一點0.463元，縮水嚴重，因此我們一年的健保申報總點數，要高出實際健保給付的總點值相當多。但下一年度的醫院總額是以前一年的申報總點數來計算的，為了明年的總額額度，今年還不宜加入卓越計劃，雖然慢加入者必須忍受相當大量浮動點值縮水所造成的虧損，然明年我們的成長將趨緩，才是加入卓越計劃的最好時機。
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